巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，也叫做卵巢子宫内膜异位囊肿。当巧克力囊肿体积增大后在外界力量的作用下，有可能会发生破裂，破裂后囊肿内的内容物会对腹膜产生刺激性会引起严重的腹痛，此外囊肿内的子宫内膜活性物质，会进入盆腔种植到盆腔腹膜，引起女性盆腔疼痛的现象发生，还可以改变女性盆腔内的环境，从而影响女性输卵管的蠕动功能影响女性怀孕，所以对于卵巢巧克力囊肿一旦发生破裂是比较严重的。脱落的子宫内膜具有生长功能，种植到哪儿那就会形成小的囊肿，甚至会引起排便功能的问题甚至引起肠梗阻。

卵巢巧克力囊肿是子宫内膜移位重的一种特殊类型，是具有生长功能的子宫内膜、腺体或者间质侵入卵巢组织，而引起的卵巢巧克力囊肿这种。在卵巢部位的内膜会随着月经周期的改变而发生生长出血，从而引起巧克力囊肿，这种囊肿会影响卵巢功能，但是不一定会引起卵巢早衰的，二者没有一定的相关性。在一般情况下，对于卵巢巧克力囊肿的患者，可以服用药物进行调理。平时日常生活中可以多喝水，多吃新鲜的青菜和水果，注意腹部保暖，避免着凉受寒，注意性卫生，勤换内裤，避免过多的宫腔内的操作。如果囊肿较大时，则需要进行手术治疗，所以在临床上不是所有巧克力囊肿的患者都一定卵巢早衰。

巧克力囊肿和多囊卵巢综合症是由本质上的区别的。巧克力囊肿是属于子宫内膜异位症，它是子宫内膜异位症的一种特殊的类型，是具有生长功能的子宫内膜异位到了卵巢上，所以引起的卵巢囊肿。而多囊卵巢综合症本身很复杂，它是由于妇科内分泌异常，以及机体全身代谢性异常所导致的一种综合病症。多囊卵巢综合症在临床上主要表现为女性的月经不调、月经稀发甚至闭经、激素水平紊乱，多毛痤疮，从而影响怀孕，导致卵泡不发育，排卵障碍；而巧克力囊肿的排卵功能以及月经情况，大多数的患者都是正常的，所以二者之间是有本质上的区别。

巧克力囊肿的主要症状为疼痛、盆腔包块和不孕。疼痛主要表现为痛经，月经来潮前或者月经前后下腹部为主的疼痛。疼痛可能与月经周期有关系，也可能与月经周期无关，时轻时重。此外，还可引起深部性交痛。有时会引起进行性痛经。巧克力囊肿是引起不孕的常见原因，在不孕患者中，50%的病因与巧克力囊肿有关系。子宫内膜异位症引起不孕的原因很多，可能是卵巢功能本身的问题，或者腹腔微环境的问题。巧克力囊肿形成病灶以后，由于每月一次的反复病灶出血，巧克力囊肿会逐渐长大。长大的过程中，如果张力过大，囊肿就会破裂。如果内容物较多或者较大，就会导致急性的剧烈腹痛；如果囊肿很小或者破口很小，破口可以自然闭合，但流出去的囊内液会导致囊肿与周围器官粘连。巧克力囊肿破裂会引起急性下腹痛，这种情况需要急诊手术治疗。

巧克力囊肿是由经血逆流，体腔上皮分化引起；还与遗传、免疫与炎症因素、局部微环境等因素有关。1、经血逆流，经期时子宫内膜腺上皮和间质细胞可随经血逆流，经输卵管进入盆腔，种植于卵巢和临近的盆腔腹膜，并在该处继续生长、蔓延，形成盆腔内异症。2、体腔上皮化生学说，认为卵巢表面上皮、盆腔腹膜均由胚胎期具有高度化生潜能的体腔上皮分化而来，在受到持续卵巢激素或经血及慢性炎症的反复刺激后，能被激活转化为子宫内膜样组织。异位的内膜与子宫腔内的内膜一样，都会随着卵巢分泌的雌孕激素的变化而变化，发生坏死脱落流血，但因为没有排出的通道，只能集聚在卵巢内，久而久之形成囊肿。因为囊肿的内容物是子宫内膜和陈旧性的血液，样子很像巧克力，所以称为巧克力囊肿。