葡萄膜炎的病因很复杂。超过50%的葡萄膜炎没有明显的病因。大多数属于自身免疫性疾病。由于葡萄膜丰富的毛细血管网，血液循环的病原体在此处有较多停滞的机会；抗原抗体复合物易于沉积，局部发生阿尔萨斯反应；色素是一种自身免疫性组织，容易发生自身免疫反应，对某些有毒化合物具有特殊的亲和力和聚集性。它也可能是由创伤、化学物质或疾病在邻近组织的传播引起的。