首先要说明的是，任何疾病不及时治疗都会造成很严重的后果。扁平苔癣是一种皮肤、粘膜均可受累的非感染性慢性炎症，可独立发生于口腔或皮肤，也可同时罹患，病损除口腔以外，还可少见于生殖器、指甲、趾甲。由此可见，扁平苔藓病不及时治疗对身体的损害时很严重的。

1、消化系统危害：有消化系统症状的病人占10%～30%。表现为消化功能紊乱，或伴有肝、肾及十二指肠溃疡等疾病。

2、神经系统危害：由神经系统症状者占20%～50%。表现为自主神经系统功能紊乱，精神紧张，失眠多梦，健忘等。从病史中多见精神创伤引起发病或使病情加重的病例。

3、高血压：有高血压病人占5%～10%，国外有人认为口腔扁平苔藓与高血压关系密切。

4、糖尿病：国外学者反响口腔扁平苔藓病人中13%同时患有糖尿病。我国资料显示患糖尿病的不超过5%，但临床上往往见到当血糖及尿糖增多时口腔或皮肤的病情加重。反之，当血糖得到控制后口腔及皮肤的损害多会减轻或愈合。

5、其他全身疾病：如心脏病、关节炎、泌尿系统疾病、女性月经不调、过敏、贫血等均有伴发，各在5%～10%。总之口腔扁平苔藓病人不伴发全身疾病仅在少数，低于10%。