通过非淋菌性尿道炎的概述知道，此病是一种以衣原体(chlamydiae)和支原体(mycoplasma)为主要致病微生物导致的泌尿生殖系统感染，主要通过性接触传染，临床过程隐匿、迁延，临床表现轻微，常伴发上生殖道感染。

而非淋菌性尿道炎概念一直引起国内外学者的争论，因为本病原指由淋病奈瑟菌以外的其他致病微生物引起的尿道炎，但实际上除衣原体和支原体外，其他病原所占比例非常少，再者感染部位并非仅局限于尿道，而是可以波及整个生殖道，侵及前列腺、附睾、精囊腺、子宫内膜、附件及盆腔，女性尤其如此，淋菌后尿道炎实际也属于非淋菌性尿道炎的范畴，但目前淋菌后尿道炎仍沿用原来的概念。

非淋菌性尿道炎发病率高、并发症多且危害较大。资料显示1995年美国各种性病中，衣原体感染导致的非淋菌性尿道炎发病率最高，仅衣原体D-K型在人群中的感染率即达百分之四十估计每年有300万-400万例患者。1997年我国8种性病报道发病构成比中，非淋菌性尿道炎占第三位，低于淋病和尖锐湿疣，而天津、上海、广东、广西和海南非淋菌性尿道炎的报告数均超过淋病而居首位，这种差异可能与非淋菌性尿道炎检测条件有关。