男性龟头上长水疱，可能是患有单纯性疱疹、接触性皮炎，建议在医生的指导下进行正确处理。

1.单纯性疱疹：病毒引起的龟头疱疹，主要是因不洁性生活接触或其他密切接触方式感染引起。单纯性疱疹多为无痛性疱疹，患者在2-4天后会出现水疱破裂，形成溃疡或糜烂，自觉疼痛，时常伴有腹股沟淋巴结肿大，部分病人会出现头疼、乏力、发热等全身症状。患者被生殖器疱疹病毒感染时，需要及时到皮肤性病科或泌尿外科治疗，在医生的指导下服用阿昔洛韦分散片、盐酸伐昔洛韦片等药物。注意尽量不要将水疱弄破，若将水疱弄破，皮肤黏膜创面暴露后，易存在病毒感染的概率，且龟头感染不易治疗，严重者应及时针对病因选择合适的外用药膏治疗，如红霉素软膏、阿昔洛韦软膏。

2.接触性皮炎：有可能因局部接触过敏性物质刺激，比如避孕套、药膏等导致过敏，会让患者龟头长水疱的情况出现，可以在医生指导下及时应用氯雷他定片、盐酸西替利嗪片、地氯雷他定片等药物。

建议平时多注意个人卫生，日常清洗龟头,保持龟头清洁。要养成良好的生活习惯。