膜增生性肾小球肾炎亦称为系膜毛细血管性肾小球肾炎，目前认为膜增生性肾小球肾炎是免疫复合物介导的肾小球肾炎。

膜增殖性肾小球肾炎目前尚无特效治疗，需针对单个患者进行个体化的治疗，即针对不同的症状采取对症治疗。例如：有水钠潴留每日摄入钠不应超过2g，已有肾功能损害者应适量地控制蛋白质摄入。此外，适当地对膜增殖性肾小球肾炎患者应用血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)和血管紧张素受体拮抗剂(ARB)可减轻蛋白尿，延缓肾功能减退。

在治疗膜增殖性肾小球肾炎的免疫抑制剂中，小样本研究显示，吗替麦考酚酯(MMF)可以减少膜增殖性肾小球肾炎患者的蛋白尿，而环孢素和环磷酰胺的疗效不佳。在小样本研究中糖皮质激素治疗中要严密观察，避免和减少激素不良反应的出现。在儿童患者中，隔日长疗程糖皮质激素治疗有一定的疗效，而在成人长程激素治疗疗效尚需进一步验证。

对膜增殖性肾小球肾炎患者进行抗凝抗血小板治疗亦有一定疗效，常用的抗血小板药物是双嘧达莫和阿司匹林，华法林容易出现出血，需慎用。抗凝治疗常选用尿激酶、低分子肝素，有时起到改善肾小球滤过功能的作用。