许多人把“窗口期”误认为是疾病的潜伏期。实际上，“窗口期”与潜伏期是完全不一样的。“窗口期”是感染病毒后不能通过检测方法诊断的一段时间，而潜伏期是感染病毒后没有出现临床症状的一段时间。例如艾滋病毒感染的潜伏期很长，可以长达许多年，但“窗口期”仅仅只有～21天。