免疫系统疾病指由于机体免疫系统障碍而引起的全身多系统、多器官损害的一组疾病。除了发生严重全身脏器损失从而导致妇女生育能力下降外，患有免疫系统疾病的妇女生育力大多正常，并不影响怀孕。但是随着妊娠进展，全身各个系统负荷加重，可能诱发或加重原有的免疫系统疾病，并造成或加重各个系统的损坏。同时，循环免疫复合物的聚集可能影响胎盘功能，并透过胎盘影响胎儿，从而造成流产、死胎、妊娠期高血压疾病等不良妊娠的出现。