在注射萘普生钠的时候偶有副作用。患者可有皮肤瘙痒、呼吸短促、呼吸困难、哮喘、耳鸣、下肢水肿、胃烧灼感、消化不良、胃痛或不适、便秘、头晕、嗜睡、头痛、恶心及呕吐等，发生率一般为3％-9％。.视力模糊或视觉障碍、听力减退、腹泻、口腔刺痛或痛感、心慌及多汗等，发生率为1％-3％。