衣原体可通过性传播，其次，因自己不注意间接的接触被污染的衣物、生活用具、工作环境（如：公共场所，服务行业等），医源性接触等导致传染；是引起男女非淋菌性泌尿生殖系统感染的主要病原体之一。对于男性常最容易引起前列腺炎、也有引起附睾炎、精囊炎，睾丸炎导致精液不液化，少精、弱精或高畸形精子症，而精子受损畸变可引起胎儿畸形，使生育力受到影响。