孕期的时候是可以做亲子鉴定的，但是要在固定的时间内去做。一般在怀孕11~13周时，可进行绒毛穿刺检查，通过提取胎儿绒毛组织和疑似父亲样本、母亲样本同时进行比对。绒毛亲子鉴定的优点是可以让孕妇在怀孕早期明确胎儿的生物学父亲，及时采取措施，决定保住胎儿或者将胎儿在3月前流产，对于孕妇本人损伤较小。但由于绒毛穿刺导致胎儿及母体组织感染风险较高，一般不建议采用。