胰腺囊肿较小时，一般不引起临床症状。囊肿增大压迫周围器官时，可产生上腹部疼痛和左腰背部的牵引痛。囊肿压迫肠道后，可有餐后上腹饱胀或不适感，继则食欲不振、恶心、呕吐等消化道症状。囊肿压迫胆总管时，可出现黄疸。在炎性或恶性肿瘤时全身症状明显，一般多出现体重减轻及身体消瘦衰弱等。通常可在上腹部触及一圆形或椭圆形囊状物，表面光滑，并有波动感，但不能移动。约95%囊肿位于上腹部偏左侧。