常见的消化系统的疾病主要是根据消化系统的具体部位来分的。主要有八类，分别是食管、胃十二、小肠、结肠、肝脏、胆囊、胰腺以及腹膜或肠系膜。不同的部位常见的疾病也大不相同。食管疾病：食管炎、食管癌、食管贲门失弛缓症。胃十二指肠溃疡：消化道溃疡、胃癌、十二指肠炎、胃神经官能症。小肠疾病：急性肠炎、肠结核、肠吸收不良综合征、克罗恩病等。结肠疾病：各种痢疾、结肠炎、肠激惹综合征、结肠癌等。肝脏疾病：肝炎、肝硬化、肝寄生虫病、肝脓肿，肝癌等。胆囊疾病：胆石症、胆囊炎、胆管炎、胆道蛔虫症等。胰腺疾病：急慢性胰腺炎和胰腺癌。