缺铁是常见的原因，不止缺铁，还可能缺乏其他营养素，如维生素A、维生素B族、钙质等。其次，可以考虑是低氧血症或者高原反应诱发的。当指甲得了灰指甲后，有的也会出现指甲凹凸不平、变黄等症状。此外，还可能与其他疾病有关，如雷诺病、心脏病、甲状腺功能减退症、指甲真菌感染、指甲外伤、肌肉和骨骼疾病等。临床上也有因密切接触化学化合物，而导致指甲凹陷的。