齿线被看作肛门和直肠的分界线，以这条线为判断依据，上肛瘘属于高位肛瘘，下肛瘘属于低位肛瘘。另外，只有一个瘘口时，叫做单纯肛瘘，如果同时有多个瘘口或外口，称为复杂肛瘘，瘘管过长或弯曲时，也被称作复杂性肛瘘。应准确的区分不同类型的肛瘘，因为其类型不同，治疗方案也不同。