经常进行痔疮灌肠治疗的患者容易出现以下副作用，比较常见的是肠道的消化功能异常，导致出现饮食不佳，食欲下降等问题。此外，如果长期进行灌肠也会导致排便习惯不正常，因为破坏了肠道的平衡系统，降低肠道的敏感性。同时灌肠对于身体的消耗较大，一般不建议体质不好的患者进行这种方法。