出现胃间质瘤可以进行内镜超声检查，这种疾检查可将胃肠道明确划分为不同的水平，能清楚地确定肿块的起源水平、大小、密度、生长方向和浸润深度，有时可发现肿块为脂肪密度，可诊断为脂肪瘤，或与胰腺的表现非常相似，因此应考虑移位胰腺，如果发现有阴影可以明确是胃间质瘤。