小儿肌阵挛性癫痫，主要是由于患者代谢出现异常，先天发育有了障碍，在围产期由于缺氧，神经系统出现了感染或者癫痫持续状态，导致脑部缺氧引起的。由于遗传因素导致的发病几率在10~15%，由于违产期发病因素占10~36%，出生后导致癫痫的几率，10~25%，大部分患者发病原因不明。