肠阴道瘘的治疗目的是闭合瘘口，避免复发，保护肛门括约肌功能，缩短愈合时间。由于瘘管持续存在，在大量细菌对粪便的长期刺激下，往往会合并不同程度的局部炎症，瘘管周围往往会形成纤维疤痕组织，因此保守治疗往往难以奏效，手术修复是直肠阴道瘘的唯一治疗方法。直肠阴道瘘的保守治疗无效，手术是唯一的治疗方法。