脑干和脊索是两个不同的部分。脊索瘤是生长在脊索的肿瘤，属于先天性疾病，可导致颅骨破坏。脊索动物位于脑干外，而脑干肿瘤是指生长在脑干内或脑干周围的肿瘤，大多是获得性的，具有高风险。脊索瘤和脑干肿瘤可以通过手术治疗，而两个不同部位的肿瘤具有不同的性质、不同的手术方法和不同的预后，而脑干及其周围的肿瘤，无论是良性的还是恶性的，都具有极高的手术风险和较差的预后。