先天性肠闭锁出现最早的症状是孩子出现呕吐，根据新生儿肠闭锁位置的不同，产生呕吐的情况也不一样。肠闭锁的新生儿胎便出现的时间比较晚，而且量会少，还可能会出现排出透明的像胶水一样的物质，而且患儿并没有正常的胎便持续排出。长期不进行治疗很大可能会导致肠道穿孔、腹膜炎和败血症。出现这些情况后会迅速恶化。