门静脉血栓形成主要是在肝硬化和门静脉高压的基础上形成的。门静脉高压症导致门静脉血流缓慢，是门静脉血栓形成的主要因素。如果形成门静脉血栓，最严重的并发症是肠系膜上静脉血栓的形成，这是肠血管回流的途径。如果肠系膜上静脉血栓形成，并且患者整个肠道的血液回流受阻，则会发生肠坏死。必须采用介入或手术方法打开门静脉或肠系膜上静脉，甚至需要肠切除。