临床上的不同时期是有不同症状的，首先不严重时，吞咽困难可能不明显，其次当狭窄非常严重时，吞咽困难会非常明显，然后是患儿常有吞咽困难，如不同程度的吸吮、呕吐等。此外进食固体食物，吞咽困难症状会更明显，另外在儿童先天性食管狭窄，会有发育不良。