并发症来自呼吸系统的损害，可出现慢性干咳，不同程度的支气管和细支气管粘膜也可累及，会出现间质性改变，甚至出现肺动脉高压;若消化系统症状复杂，胃肠道症状最为常见。因为唾液减少了干燥导致食道,会出现吞咽困难,仍然会出现萎缩性胃炎和消化不良,在其他患者,肝损伤可能发生,表现为肝脏肿大,肝酶和碱性磷酸酶的高程,病理活检可能显示病变与原发性胆汁性肝硬化和慢性活动性肝炎。胰腺病变相对少见。