实际上，大多数手足口病相对较轻，而且预后良好。它们大多会在一周左右的时间内治愈，而且没有后遗症。但是，少数重症儿童在疾病发作后可以迅速影响神经系统和呼吸循环系统，从而导致一系列相关的脑干、脑炎、脑脊髓炎和脑积水。它可以发展成循环衰竭以及神经炎症性肺水肿等，这种就是相对严重的了。