自身免疫性胰腺炎是一种良性纤维性炎性改变，一般自身免疫性胰腺炎无法自愈。主要需要减轻疼痛亦或者进行对症治疗，主要需要使用激素进行治疗，此外也可以使用免疫抑制剂治疗自身免疫性胰腺炎。此外也可以使用生长抑素，可以抑制胰腺分泌。此外质子泵抑制剂也可以使用治疗自身免疫性胰腺炎。