松果体囊肿手术风险更大，更侵入性的，因为松果体属于大脑，在那里的血管，神经和重要的脑组织密集的深层核心部分。受损的运动，复视，操作过程中大出血，术后偏瘫，甚至昏迷，死亡等。松果体囊肿不会轻易操作，除非囊肿引起梗阻性脑积水，导致患者出现头痛、恶心、呕吐甚至昏迷等症状时才需要进行手术。