长期以来，大量的免疫抑制药物、抗癌药物、器官移植、白血病、淋巴肉瘤、系统性红斑狼疮、结核病、糖尿病等患者已成为该病的主要易感人群。新生隐球菌主要从呼吸道吸入。新生隐球菌在皮肤粘膜和消化道感染后是否侵入人体与机体的免疫功能密切相关。人类感染新生隐球菌主要涉及肺和中枢神经系统。新生隐球菌入侵后，随血液传播，血脑屏障被破坏，引起脑膜炎。