许多胃肠疾病会引起蛋白质的丧失。蛋白质丧失性胃肠病的发病机制是胃肠粘膜糜烂和溃疡引起蛋白的渗出和漏出，粘膜细胞的损伤和缺损，粘膜透过性增加，血浆蛋白质向肠腔漏出。肠淋巴管闭塞，含有丰富蛋白质的肠间质不能被间质保持或被血流吸收，溢出到肠腔而失去。肠道炎症引起蛋白丧失性胃肠症的机制，可能是由炎症区细胞外液和炎症性液体的渗出引起的。