巴氏腺囊肿在临床上没有疼痛，局部未发生感染，不建议用消炎药治疗。对于小囊肿，临床上可以保持外阴部分清洁，注意性生活和月经生理的卫生，在日常生活中加强外阴局部治疗，防止局部感染。如果巴氏腺囊肿比较大，需要开窗手术，并进行适当的治疗。临床上，由于局部感染，出现与红肿、发烧、疼痛等相应的症状时，使用消炎药进行治疗。如果化脓需要切开给予引流达到治愈的目的。