抗磷脂抗体综合征常同时具有多种临床表现。不明原因静脉血栓形成是抗磷脂抗体综合征最常见的症状。然而，血栓形成可发生在肿瘤、口服避孕药、肾病综合征、血小板增多症、抗凝血酶Ⅲ缺乏症、蛋白C缺乏症、蛋白S缺乏症、纤维蛋白原异常、红细胞增多症、阵发性夜间血红蛋白尿症和尿高胱氨酸血症，诊断时需加以鉴别。