利巴韦林颗粒的主要副作用是溶血性贫血，这将显示出在口服治疗后的前1-2周血红蛋白的下降。利巴韦林颗粒在使用中也会有全身不良反应，主要有乏力、头痛、无力、胸痛、寒战、发热等症状，神经系统症状主要有眩晕、消化系统症状如食欲不振、胃部不适、恶心呕吐、轻度腹泻、便秘、消化不良、肌肉、骨系统可能有肌肉疼痛、关节疼痛等。