肛瘘对患者的危害是很大的，肛瘘是直肠粘膜与肛门周围皮肤直接形成了异常通道，会反复引起肛周脓肿，并且有可能会有大便从瘘口流出。一旦得上肛漏就会非常痛苦，因为肛门处经常流脓，刺激周围皮肤，引起湿疹、搔痒、伤口经久不愈合。有时外口封闭暂时自愈，但因脓液仍在里边积聚引起肿胀疼痛，待肿块破溃，脓液流出，痛即减轻。结核性的肛漏可有低烧、消瘦、食欲不振和盗汗等症状。