男性沙眼衣原体阳性并不属于特别严重的疾病，在临床上称为非淋菌性的尿道炎，可以通过使用药物来进行治疗，例如可以在医生的指导下服用阿奇霉素等药物，通过有效的治疗之后，多数的患者是可以得到完全治愈的，所以不用太过的担心，如果男性已婚或者是有性伴侣，需要和性伴侣共同进行治疗。以免在男性治疗好之后，再次出现感染的可能，如果长期不进行治疗，有可能会导致不育症。