因为有的甲状腺肿瘤是恶性的，也有的是良性的，所以引起甲状腺肿瘤的病因是不一样的。恶性肿瘤可能与遗传、放射线有关。这两种高危因素易引发甲状腺癌；良性肿瘤最常见有弥漫性甲状腺肿大，及结节性甲状腺肿，可能与饮食中缺碘有关，又包括绝对缺碘和相对缺碘，绝对缺碘呈地区性特点，而相对缺碘则与青少年发育、女性妊娠等特殊生理期有关。