常见原因是由于发烧本身的并发症导致出现的脚底起水泡的情况，也不排除是由于出现了细菌感染以及病毒感染导致的手足口病引起的。如果在服用药物以后脚底起水泡的情况不见好转，需要到医院进行相关的检查，查明病因，不要盲目使用抗过敏的药物以及退烧药，以免出现不良反应。