引起宫颈癌的约12种低危险型HPV。但是，这些HPV会引起生殖器尖圭线粒体和非常弱的宫颈细胞的变化。低危险HPV包括6，11，40，42，43，44，53，54，61，72，73和81。其中HPV6和11是最常见的低危险型HPV，90%的生殖道尖圭线粒体与此相关。低危险型主要引起肛门，外生殖器，尿道口，阴道下段等部位的尖锐湿疣，以及低度宫颈上皮内肿瘤的CINI。