扁桃体是咽部最大的淋巴组织，是拥有免疫功能。扁桃体切除后免疫功能会受一定影响，但并没有特别大。因为喉部除了扁桃体以外，其他淋巴组织也会代偿其功能。扁桃体切除后，局部创面瘢痕增生挛缩，导致咽部不适、紧张。有些人的扁桃体还残留着残体，炎症刺激后增殖，必要时再次开始手术。