胆管良性狭窄大部分与结石相关或者与胆道蛔虫症相关。胆道蛔虫症现今比较少见，指胆道蛔虫进入胆总管后，使胆管壁受损引起收缩，造成胆管狭窄，使胆红素升高或者转氨酶升高。只要把奥迪括约肌打开，症状会慢慢缓解。胆囊结石引起的胆管良性狭窄较常见，但是胆囊切除术后胆管良性狭窄患者较少，需先排除肿瘤，即结石引起的器质性病变外，才能诊断为胆道原发性狭窄或良性狭窄。胆道良性狭窄最常见的病因是胆囊切除术中直接或间接的胆道损伤，开腹胆囊切除术胆道损伤的发生率较低，而腹腔镜胆囊切除术似乎并未降低胆道并发症的发生率反而有升高趋势。此外，上腹部外伤、硬化性胆管炎、Mirriz综合征等也会致胆管狭窄。