正常人体的胃食管有一个保护机制，主要包括食管下段的括约肌、收缩His角，还有人体的食管有廓清运动，这些在其共同作用下，能有效地阻止过多的胃内容物反流的发生，来抵抗反流物对食管黏膜的损伤。食管如果保护机制受损伤导致保护机制功能障碍和食管下括约肌功能障碍，它的保护功能降低，胃腔内包括胃酸、胆汁经常会反流逆流入食管。保护机制的损伤因素还包括食管的底部运动异常，极少个别的患者有食管外的机械压迫等，在综合的多因素的作用下，会导致抗反流机制的损伤，损伤机制的加重就会导致胃食管反流。正常人体也有胃食管反流，但是它是生理性反流，不会引起人体反酸、烧心的症状，如果损伤加重则反流加重，人体会出现典型的反酸、烧心症状，一般需要及时治疗。