癌胚抗原高可作为肿瘤标志物，但最重要的是应用于疾病的预后监测。癌胚抗原常见于空腔型器官，产生肿瘤时结果偏高。癌胚抗原在平常应用中，一般不单独应用，因为不具有器官特异性，通常和其他肿瘤标志物联合应用，监测肿瘤的发生和发展。癌胚抗原检测数值比正常参考值的上限高出几倍，或连续检测每次结果都不断上升，就要高度怀疑肿瘤。如果已经诊断肿瘤，经过手术后检测结果明显下降，说明手术有效，如果手术一段时间后，肿瘤标志物又上升，或手术后肿瘤标志物的结果没有下降，说明手术切除不干净或有肿瘤复发。