巧克力囊肿实际是长在卵巢上的一个囊肿，它的囊内液是巧克力的颜色。一般来讲，巧克力囊肿常常是因为卵巢的子宫内膜异位症造成的，正常的子宫内膜异位到卵巢的表面，随着月经出血而出血，时间长了以后就形成咖啡色的囊肿。囊肿会伴随着月经的周期变得越来越大，甚至最后会发生破裂。除了卵巢的子宫内膜异位症以外，还有卵巢的浆液性囊腺瘤或者黏性囊腺瘤，也可能伴随着囊内出血而出现咖啡色的液体。到底是什么样的囊肿，就需要把它剥离出来在显微镜下观察才能知道，然后才能够去对症处理。总而言之，巧克力囊肿更多的是子宫内膜异位症或者是浆液性、黏性囊腺瘤的囊内出血。但是为什么会得，这个原因目前还不清楚。