肝外胆管结石的治疗分为两部分，一种是消化内镜下的治疗，另一种是外科手术的治疗。外科手术的方式，目的是通过手术取出结石。手术的方法包括胆总管的探查取石、引流。如果同时合并有胆囊的结石和胆囊的炎症，在情况允许下，可以同时进行胆囊的切除。如果发现合并有肝内胆管的结石在大胆管里，就要进行取石和引流。如果在一侧的肝段或肝叶，就可以联合肝脏的局部性、区域性的切除。消化内镜下的治疗，包括经过12肠境逆行的胰胆管造影，做ERCP把乳头括约肌切开，进行取石。也可以放置鼻胆管或胆道支架进行胆道引流。目前针对于胆管结石的治疗，有内科和外科联合的办法，一般能进行合理和有效的治疗。