临床上有三种原因会引起肝脓肿，一种致病菌就是以肠道革兰氏阴性杆菌为主的普通细菌，还有一种是特殊的寄生虫性的微生物阿米巴滋养体，另外还有真菌，也会引起肝脓肿。肝脓肿发生的共同原因，就是免疫功能低下，身体不能消除潜入到肝脏的各种疾病因素，常见于糖尿病患者和肿瘤晚期的患者，所以在肝脓肿的病因里面有两个最主要的辅助因素，就是血糖控制不好的糖尿病患者，以及肿瘤患者晚期免疫功能下降的患者。在这两大因素的作用下，三种细菌通过血液循环进入到肝脏里面就会引起肝脓肿，因此肝脓肿，不同的类型有不同的病因，也有共同的原因。