睾丸萎缩大多数受内分泌、化学物质、物理因素、感染等等因素的影响。第一、睾丸是受到下丘脑、垂体、性腺轴激素的调控，如果由于先天性的性腺轴异常，或者由于垂体肿瘤，或者由于放疗、药物等因素导致的性腺轴内分泌激素的异常，引起第一促性腺激素水平改变，可以导致睾丸的萎缩，第二、最常见的因素是感染，腮腺炎病毒和某些特定的细菌感染所导致的睾丸炎，可以造成严重的睾丸萎缩的影响，第三、精索静脉曲张、高温等物理因素也可以导致慢性的睾丸损害，导致慢性萎缩，第四、某些化学药物和化学物质也可以造成睾丸萎缩。