视神经萎缩的发病原因非常多，如常见的外伤、缺血性视神经病变、视神经炎等等。临床上又以下列原因为主：第一、视神经炎，包括多种亚型如视神经脊髓炎、脱髓鞘性视神经病变包括一些多发性硬化以及免疫相关性的视神经炎等，后期都可以出现视神经萎缩，第二、肿瘤的压迫、浸润，在中晚期就可以出现视神经的萎缩，第三、遗传因素如常染色体显性遗传视神经病变，Leber遗传性视神经病变后期也能引发视神经萎缩，第四、中毒及营养障碍型视神经萎缩，第五、青光眼的后期，也可以出现视神经萎缩。