大拇指根部凹陷很深，有可能是反甲、甲横沟、甲纵沟等，多与心血管疾病有关，可能会导致组织缺血、缺氧，也有可能是甲癣。建议患者到医院检查，如果是甲癣，患者通常可遵医嘱使用盐酸特比萘芬片、灰黄霉素片、伊曲康唑胶囊等药物治疗，缓解症状。