出现慢性腹泻后可以吃磺胺类药物，该类药物有很好的止泻疗效，不过服药时最好遵听医嘱。如果腹泻情况比较严重，则可以应用吸附性止泻药。另外，因细菌、真菌引起的慢性腹泻，可服用抗生素来抑菌杀菌，达到治疗目的。而中药上可以服用人参健脾丸、六君子丸、附子理中丸等中成药来治疗慢性腹泻。

小儿慢性腹泻的病程一般会持续两个月左右，还有的患儿可能不会持续性的腹泻，但每次发作间隔时间都在两到四周不等。患儿每次病情发作时，都会表现为大便次数增加、大便性状稀薄，且伴随有腹痛、肚脐胀痛的症状。而导致慢性腹泻病程延长的原因，主要是原发病未能及时控制有关。

慢性腹泻和急性腹泻的发病原因、症状表现、发病时长，以及治疗方法都有所不同。慢性腹泻的病因比较复杂，可能是因为疾病或受到了感染所造成的，如果不及时治疗，可能会出现营养不良的情况，且发病时间较长，在治疗上需要根据病因针对性处理。急性腹泻主要是因为吃了不干净食物所造成的，发病时间比较短，患者容易出现发热的症状，需要使用一些调节水电解质的药物。

慢性腹泻患者可以进行实验室检查、影像学检查、黏膜活组织检查、大便常规检查、纤维肠镜检查、胃镜和小肠镜检查等等。通过这些检查方法，能够有效的判断慢性腹泻的严重程度以及病变部位，然后结合检查结果，制定最合理的治疗方案，其中纤维肠镜检查是最全面且最直接的一种检查方法。

引起慢性腹泻的原因很多，可以选择西医治疗，比如对症应用抗生素、氨基水杨酸制剂、微生态制剂等药物治疗，或者选择手术切除肿瘤等止泻；也可以服用中药辨证治疗，比如平胃散、葛根岑连汤加减、少腹逐瘀汤加减等，止泻效果也不错。