宝宝慢性腹泻的治疗方法有多种，首先需要使用对症治疗，其中包括预防脱水和平衡营养，出现脱水的情况就要补充液体。除此之外，还可以使用中医疗法，其中包括中医推拿和中药敷贴，在治疗的过程中需要做好护理工作，维持自身的营养，一旦出现不良反应，就要及时纠正。

出现慢性腹泻后可以吃磺胺类药物，该类药物有很好的止泻疗效，不过服药时最好遵听医嘱。如果腹泻情况比较严重，则可以应用吸附性止泻药。另外，因细菌、真菌引起的慢性腹泻，可服用抗生素来抑菌杀菌，达到治疗目的。而中药上可以服用人参健脾丸、六君子丸、附子理中丸等中成药来治疗慢性腹泻。

导致小儿发生慢性腹泻的原因主要是因为肠道菌群失衡，因为新生儿菌群尚未形成，如果在受到细菌、病菌和真菌等多种致病菌感染后，滥用抗生素的话，就容易引起慢性腹泻。另外，长期营养不良、乳糖不耐受和喂养不当的话，也容易造成小儿出现慢性腹泻的情况。

慢性腹泻的主要危害之一是会导致肠道菌群失调，可诱发真菌性肠炎、肠出血等多种大肠疾病，严重时可能会导致肠穿孔。同时会因为长期性腹泻而出现免疫力下降的情况，且会因此而发生继发性感染。除此之外，还会引起营养不良和肝肾功能异常。

慢性腹泻的推拿治疗方法之一就是揉外劳，也就是说按揉手背中央的外劳宫穴，再就是补脾土，也就是在脾土穴做顺时针推拿。运内八卦也是慢性腹泻常见的推拿治疗方法。除此以外，摩腹、揉脐以及按揉足三里等推拿方法也都有助于治疗慢性腹泻。