小儿多发性抽动症的发病原因非常复杂，可能是由于脑神经递质数量不足所致，也可能是大脑发生器质性损害引起。同时经过临床研究发现，该病与基因遗传等先天性因素也有一定的关系。除此之外，还有可能是压力过大、精神打击以及日常饮食不当所致。